三清山是野生药材的大宝库，有草木、木本、真菌 3 大类 1500 多种。 吊桥一带、梯云岭、琼台和玉京、玉虚、玉华三峰之间， 更是野生药材的聚生之地。 民间药农经常采集的， 首推厚朴、黄连、鹿衔草、何首乌、前胡、南沙参、滴水珠、七叶一枝花、杜仲、女贞子、五味子、黄荆以及云雾草、石耳等。
厚朴 落叶乔木，木兰科。夏季开花，花红色有香气。根皮、干皮、花果均可药用。皮紫褐色。具有温中下气、化湿行滞之功能，主治胸腹胀痛、消化不良、肠梗阻、痢疾和痰饮喘满。
杜仲 落叶乔木。树皮可入药，味苦微辛，性平，具有祛风活络之特效。
黄连 多年生草本。生长于山上林间的阴湿之处。根状茎细长柱形，节多且密如鸡爪；其味极苦，性寒，具有清热燥湿、泻火解毒之效。
鹿衔草 又名鹿啼草、破血丹。夏季由叶丛中抽出花萼，花白绿色，数朵至 15 朵成顶生总状花序。多生在山上阴湿处或山沟两侧。全草可药用，味苦性温，具有祛风除湿、止血等功能。
七叶一枝花 多年生草本，生长于山中阴湿坡地、山谷。单茎直立，叶 5 片至 9 片，通常 7 片，茎顶生出一花。入药用根茎，苦寒有微毒，具有清热解毒、消肿止痛之效。主治多种炎症，又为治毒蛇、毒虫咬伤之良药。
石耳 又名石壁花、地耳、石木耳。状扁平，呈不规则圆形。其色上为褐，下为黑。多生长于山上悬崖岩壁上，四季可摘。入药有清热止血、止咳化痰之功效；入菜是山中珍肴之一。民间药农采摘石耳功夫非浅。进山时要带上粗大棕绳和爪钩，沿着地势较缓的地方登上山顶 然后，腰缠绳索从悬岩顶上缓缓而下，一朵朵地采摘。摘到后复抓紧绳索登上山顶。由此， 石耳的身价培增。在药农家能吃上一盘石耳菜， 就算是“上宾”了。
紫灵芝 腐生真菌。子实体伞形，菌盖和菌柄为黑色坚硬木质，菌肉、菌管均呈褐色。灵芝腐生于栎或其他阔叶树根或枯干上。二桥墩还有“石灵芝”斜生在峭壁之上，因岩陡如削，难以采摘，至今仍在。
