【措钦大殿】
措钦大殿至今已有500多年的历史。因为要兼容花、白、黄三教，因而全寺塑像的风格也不同于别处，此殿表现最为明显。
大殿共三层，一层有主大殿、东、西净土殿和回廊。大经堂内挂满各种唐卡，唐卡中央有一尊近八米高的释迦牟尼铜佛坐像，是白居寺的主供佛。据载，铸造这尊佛像，用去二万八千斤黄铜。措钦大殿的二层是拉基大殿，道果殿、罗汉殿和回廊等。全寺最高级别的“拉基会议”就在这里举行。罗汉殿里的“苦行山”及卜六罗汉泥塑尽皆精品，生动传神，闻名全藏。该殿主供文殊菩萨，侧供白度母，在这里可用传说中白度母的背包击背，能祛病强身。措钦大殿的三层为无量宫殿、上师殿和金色空行母殿。无量佛主殿内有八根立柱，四壁绘满密宗坛城壁画。
大殿平面参照佛教坛城样式布局。围绕白居寺大殿的经院（扎仓）在极盛时有17个之多，后经整合，7个属格鲁，3个属萨迦，1个属夏鲁。三派主持协同白居寺总主持共同管理寺院。这在藏区别处也是十分罕见的。
【十万佛塔】
十万佛塔位于措钦大殿西侧，相传为布顿大师所设计建于公元1436年，集中了各塔之所长。十万佛塔的正名叫“菩提塔”。藏语称这座塔为“班廓曲颊”，意为“流水漩涡处的塔”，这流水便是日喀则地区的年楚河。白居寺就是因为这座佛塔才格外富有魅力。它可是由近百间经堂依次重叠建起的塔，是西藏地区规模最大、制作最精美的佛塔之一。
此塔直径62米、塔高42米(共13层) ，由十三层石阶、塔基、塔腹、塔瓶、宝盖及金幢等几个建筑单元组成。塔形下大上小，递层逐渐上收。一至五层每层分20个角，共有108门，佛殿76间。六至九层不分间，六层是圆形塔腹，七层为方形，八层为覆钵形，九层为伞盖，顶部是宝瓶、宝珠，在中国建筑史上是独一无二的珍品。殿堂内绘有十余万佛像，另有千余尊泥、铜、金塑佛像，因而得名“十万佛塔”。
【扎仓】
白居寺的独特之处是各教派和平共存于一寺，因为它是在西藏各教派分庭抗礼、势均力敌的情况下建立的。极盛时寺内共有十七个扎仓，分属萨迦、噶举和格鲁三个教派。现存扎仓四、五个。
