航空：
南通机场位于市区东北12公里的通州市兴东镇。市区人民中路9号民航售票处有民航班车前往，问讯电话：0513-6560588。市区人民中路9号有民航班车前往，问讯电话：6560588。
南通兴东机场民航班期表
目的地 班期 起飞 到达 票价
北京 每日 1900 2045 760
广州 4 0955 1240 960
广州 156 1940 2240 960
青岛 135 1850 2050 710
铁路：
南通是目前我国14个沿海开放城市中惟一不通火车的城市，建设中的新长铁路（新沂--长兴）有支线从海安通往南通。
水路：
南通是我国十大港口之一，也是长江水系江河运输直达中转的枢纽。南通与上海每天有两班快艇往返。上海--汉口、上海--重庆的江轮均停靠南通。从市区、长途车站到南通港可乘4路车直达，问讯电话：0513-3512270。
终到港
南通开船时间
终到时间
主要停靠港
汉口
1810
1000
芜湖1230 铜陵1750 池州2000
安庆2240 九江0650
上海
0610
1230
直达
重庆
0000
1100
岳阳2130 荆州1200 宜昌2130
万县0700
上海
0800
1300
直达
上海
0845
1215
吴淞1100
上海
1400
1730
吴淞1615
车渡：
“南通”往南因长江阻隔，其实是“南不通”，要通过通沙（南通市天生港--张家港市西界港）、通常（通州市省军区农场--常熟市浒浦镇）、海太（海门市江心沙农场--太仓市鹿河镇）、海崇（海门市青龙港--上海市崇明县牛棚港）汽渡与苏南和上海交往。世界上跨度最大的“苏（州）--（南）通长江大桥”已开工建设，2007年建成通车后，南通将彻底改变“南不通”的历史。
公路：
南通长途汽车站位于人民西路86号，问讯电话：0513-3512816。
南通汽车站快客班次表（部分）
南通--南京 半小时一班，3.5小时可达，80元
南通--扬州 半小时一班，2.5小时可达，42元
南通--苏州 半小时一班，2.5小时可达，40元
南通--上海 半小时一班，3.5小时可达，54元
