雨林内气温暖和，雨量充沛，适合菌类生长。雨后，各色菌类象变魔术般破土而出，一夜间缀满林间溪旁。它们主要有：银耳、木耳、黄珊瑚菌、长裙竹荪、美味牛盰菌、灵芝、热带灵芝等，其中竹荪、槢圆孔牛肝菌、绒盖牛肝菌、小美牛肝菌等是名贵的食用菌。菌类在医学上有重要的价值，如灵芝菌类、牛肝菌中都有治病的珍品。