壶瓶山有陆栖脊椎动物172种，有珍稀濒危动物53种，如华南虎、金钱豹、黑熊、猕猴、苏门羚、金雕、红腹角雉、短嘴金丝燕、娃娃鱼等。《世界自然基金会―华南虎现存野外种群调查》报告亦认为壶瓶山“目前还有华南虎的繁殖种群存在”，它和武夷山自然保护区一起“是目前仅有的两处具有合适面积的华南虎栖息地”。